據臺灣媒體報道，對于代表民進黨競選臺南縣長的人選，身在獄中的陳水扁也沒閑著，他一會兒說支持陳唐山參選，一會兒說與現任民進黨籍"立委"做政治交易，支持葉宜津參選，陳水扁的這些表現在民進黨內引發不滿。

　　一直被傳言與陳水扁有心結的前行政機構負責人謝長廷更是直接表示有意見。

　　前行政機構負責人謝長廷：我對陳水扁處理的方式，我是有意見的，這是比較嚴肅的議題，我會講話，我會正式講話。

　　陳水扁的插手，也讓民進黨主席蔡英文在臺南縣提名人選方面傷透腦筋。

　　民進黨主席蔡英文：臺南縣團隊可以做最大整合，要打一個最團結選戰！

　　記者：您心中有人選嗎？

　　蔡英文：沒有，但是我有我的標準，我現在在做最后的挑選，條件已經都定好了。