據臺灣媒體報道，臺軍和臺灣法務部門已經開始聯合偵辦臺軍的買官案，臺軍將把陳水扁在任時的不正常人事變動列為首輪清查目標，以查出臺軍買官案的真相。

　　據報道，陳水扁在任八年共晉升了732名將軍，但在晉升過程中爆出了“四大亂象”。一是異常升遷，有些人沒有執行任職滿兩年才能升遷的規定。第二是“酬庸升退”，有些人晉升之后，不到一年就退伍，甚至在晉升當天或隔天退伍。第三是“逢迎拍馬”，臺軍一些將領在陳水扁到軍隊視察時曾刻意討好陳水扁以達到升官目的。第四是“扁系人馬”，也就是陳水扁在臺軍中的親信受到賞識并被一路提拔。

　　4月20日，臺軍把30名陳水扁上任以來升為上將的臺軍人員情況交給檢方特偵組。臺灣檢方要求臺軍繼續提供有關資料，以追查都是誰收了買官的錢。一旦查出具體買官證據，將不排除對陳水扁展開偵訊。