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根據竹科管理局公布的統計數字，該園區二00四年前十一個月進出口貿易總額為新臺幣八0九八億元，較二00三年同期成長百分之四十七。
以出口與進口總額區分，前十一個月出口總額為新臺幣四千五百六十六億元，進口總額為新臺幣三千五百三十二億元，分別較二00三年同期成長百分之二十九及百分之七十九。
其中，前五大出口地區依序為香港百分之二十、大陸百分之二十、日本百分之十二、美國百分之十一、韓國百分之九。
前五大進口地區依序為日本百分之三十六、美國百分之二十一、新加坡百分之八、香港百分之六、韓國百分之三。
據悉，自二00二年起香港一直是竹科最大出口地，直至去年十一月起被大陸取代。
竹科科管局統計數據顯示，二00四年十一月大陸與香港占竹科出口比例分別為百分之二十三 及百分之十九，分別較上年同期增加百分之六十五及百分之四，兩者合計約占竹科出口比重的百分之四十二。
從新竹科學園區出口地比重的變化，可看出竹科與出口地經貿關系的密切程度，二000年前竹科主要出口地以美國、日本等地為主，二00二年后，兩岸高科技商品往來頻繁，香港有第三地轉口之便，于是逐漸取代美、日等地，成為竹科主要出口地區。
據竹科管理局局長李界木分析，出口大陸比重增加，主要因竹科廠商加工品制造銷往大陸急增，而大陸與香港目前占竹科出口比重達四成以上，顯示竹科與大陸的經貿關系愈來愈密切。
