維基解密也揭露綠營矛盾。2007年陳水扁（左）拋出“入聯公投”，引起美方高度緊張與不滿，但民進黨內人士對美國在臺協會表示，公投只是選戰工具，若民進黨候選人謝長廷（右）當選，就不會再提這議題。
東南網9月7日訊 據臺灣媒體報道，維基解密資料顯示，陳水扁拋出“入聯公投”，引起美方高度緊張與不滿。不過民進黨內人士，包括副手候選人蘇貞昌在內，都明確表示公投只是選戰工具，“立委”管碧玲更對美方直言，如果謝長廷當選，民進黨就不會再提這議題，“一切都將回歸現實”。
這分由AIT高雄辦事處于2007年9月10日提交的報告，訪問南部地區的藍綠民代、黨工、學者，分析“入聯公投”的影響。報告指出，藍綠都認為，若不呼應人民爭取更大國際空間的要求，就是“政治自殺”，雙方都只把“公投”當成選舉策略，并沒有“踩紅線”的意圖。AIT報告甚至用了一個小標題：“有啥大驚小怪”（What's the Fuss？）。
管碧玲說，“入聯公投”只是臺灣選舉議題，民進黨一旦贏得2008年3月的選舉，就會拋棄（drop）這個議題，候選人在選后必須采取現實路線，到時一切都會回歸正常”。
盡管如此，美方仍然對扁當局緊盯不放：9月15日晚間，民進黨在高雄舉行入聯大游行，AIT就要求“行政院副院長”邱義仁、“國安會”秘書長陳唐山保證，扁的講話絕不會有“意外”。19日，剛從美國返臺的AIT臺北辦事處長楊蘇棣面告邱義仁，“華府氣氛不好，所有人都不高興”。
25日，候選人謝長廷告訴楊蘇棣，自己支持“公投”，但會全力抗拒深綠勢力把臺獨活動帶進選戰。謝長廷并透露給美方，陳水扁會將力推激進版“正常國家決議文”的黨主席游錫堃換掉。
28日，外事部門負責人黃志芳表示，希望美方注意陳水扁降低“正常國家決議文”激烈度的努力。不過楊蘇棣回答，即使是“降溫”版本，仍然碰觸敏感的主權議題，并指出美臺關系已被陳水扁先前各項措施所破壞。楊并要求，“臺灣作為美國的友人，政治領袖對于可能影響西太平洋局勢穩定的言行，必須采取更負責任態度。”
